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纯度高、活性强!GMP级别RNase R,助力环状RNA研究与药物开发!

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2025-06-27

环状RNA(circRNA)是一类独特的非编码RNA分子,它们通过一种称为后剪接(back splicing)的机制形成,即前体mRNA的两个外显子在剪接过程中连接成一个闭合的环状结构,从而避免了线性RNA分子常见的5'帽子和3'尾巴结构。这种环状结构赋予了circRNA较高的稳定性,使其不易被细胞内的核酸酶降解,因此它们在细胞中的半衰期较长,可以使其在实际应用端可以达到低剂量长时效的效果。此外circRNA因为不需要修饰核苷和加帽加尾等操作,所以还有相对简单的生产工艺优势,使得环状RNA 成为药物研发的热点。

 

其在药物研发中具备较大的优势,细节主要体现在以下几个方面:

01

更高的稳定性

circRNA的环状结构使其对核酸酶的降解具有抵抗力,因此在细胞内具有更长的半衰期和更高的稳定性,这对于药物的持久效果至关重要。

02

低免疫原性

相较于线性RNA,circRNA具有更低的免疫原性,这减少了可能的免疫反应,使得circRNA更适合作为药物载体。

03

高效的蛋白表达

研究表明,工程化的circRNA可以在真核细胞中稳定、高效地表达蛋白,这对于蛋白替代疗法尤其重要。

04

潜在的疾病治疗应用

circRNA在多种疾病治疗中显示出潜力,包括罕见疾病、肿瘤治疗以及作为疫苗开发的一部分。

05

创新的递送系统

正在开发的新型递送系统,如脂质纳米颗粒(LNPs),可以有效地将circRNA递送到目标细胞,这对于药物的靶向性和疗效至关重要。正在开发的新型递送系统,如脂质纳米颗粒(LNPs),可以有效地将circRNA递送到目标细胞,这对于药物的靶向性和疗效至关重要。

06

疫苗开发

circRNA疫苗在新冠疫苗开发中显示出了潜力,能够诱导产生更多的中和抗体和有效的T细胞反应,且在环境温度下比线性mRNA更稳定,有助于简化储存和运输条件。

07

基因编辑

circRNA在基因编辑领域也显示出潜力,可以作为基因编辑系统的模板,提供更持久和稳定的蛋白表达。

  

circRNA生产过程包括:模板制备、体外转录、DNA模板去除、环化和纯化。在RNA环化后需要用核糖核酸酶R (Ribonuclease R, RNase R)对未环化的RNA进行消化,达到富集circRNA的目的。当前主流使用的RNase R主要为进口品牌,存在价格高、货期久等问题,不适合用于大批量生产。

    

永利3044集团官网拥有ZymeEditor酶改造平台和专门为GMP级别产品打造的分子酶生产基地,研发生产出纯度高、消化活性强的GMP级别RNase R产品,为新一代RNA疫苗/药物上市提供助力!

   

图1.环状RNA 生产流程图

(来源:Front Immunol 2023 Jan 12:13:1091797. doi: 10.3389/fimmu.2022.1091797. eCollection 2022.)

   

RNase R(Ribonuclease R, RNase R)是一种来源于大肠杆菌的Mg2+依赖性3'→5'核糖核酸外切酶,它能消化所有的线性RNA,不易消化circRNA、套索RNA或3’端突出末端少于7 个核苷酸的双链RNA分子。RNase R常用于去除线性RNA分子,实现富集circRNA和套索RNA等非线性RNA的目的。

   

主要应用场景为:

1)基因表达研究;

2)可变剪切研究;

3)从生物样本中富集 circRNA;

4)识别内含子套索结构 RNA;

5)鉴定外显子 circRNA。

  

产品特点

  • 蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%;

  • 无核酸外切酶残留;

  • 与竞品相比,产品消化线性RNA能力相当;

  • 与竞品相比,产品对circRNA富集作用相当。

应用案例

案例一

与A进口品牌RNase R产品消化线性RNA能力相当

图.永利3044集团官网RNase R产品与A进口厂家RNase R产品消化线性RNA能力比较:将永利3044集团官网RNase R产品与A进口厂家RNase R产品分别投入含有线性RNA底物的反应体系中进行反应,结果显示当RNase R产品的投入量达到2-4 U时,可观察到RNA条带变微弱甚至消失,表明RNase R对线性RNA分子具有消化作用,且永利3044集团官网RNase R产品与A进口厂家RNase R产品对线性RNA分子的消化能力相当。

 

与A进口品牌RNase R产品对circRNA富集作用相当

案例二

图.永利3044集团官网RNase R产品与A进口厂家RNase R产品对circRNA的富集作用比较:将永利3044集团官网产品与A进口厂家RNase R产品分别投入含有circRNA底物的反应体系中进行反应,结果显示经过永利3044集团官网RNase R产品与A进口厂家RNase R产品处理后的RNA条带亮度基本无差别,表明circRNA能耐受RNase R的消化。以上结果证实永利3044集团官网产品与A进口厂家RNase R产品均能有效用于circRNA富集。

案例三

永利3044集团官网RNase R对线性RNA的切割效果优于其他品牌

图.永利3044集团官网产品与厂家A和B的RNase R消化线性mRNA分子效果比较:将永利3044集团官网RNase R产品与厂家A和B的RNase R产品分别投入含有1 μg 线性mRNA底物的反应体系中进行反应,结果显示永利3044集团官网RNase R产品对线性RNA的消化效果优于厂家A和B的RNase R。

 

产品性能

蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%

图.蛋白纯度检测:使用SDS-PAGE技术检测产品的蛋白纯度,从左到右依次为相同产品浓度下不同体积(1 μL,2 μL,3 μL)的结果,结果表明永利3044集团官网RNase R产品蛋白纯度≥95%。

 

无核酸外切酶残留

图.核酸外切酶残留检测:将20 U 永利3044集团官网RNase R加入到 0.5 μg λDNA- Hind Ⅲ digest中,于37℃孵育4小时,之后进行琼脂糖凝胶电泳 ,结果显示DNA 条带未发生变化,说明永利3044集团官网RNase R产品无核酸外切酶残留。

  

永利3044集团官网环状RNA 解决方案

  

产品信息

应用场景

产品名称

产品货号

模板制备

BspQI GMP-grade (10 U/μL)

10664ES

Bsa I GMP-grade (20 U/μL)

10661ES

体外转录

T7 High Yield RNA Synthesis Kit

10623ES

Hieff® T7 RNA Polymerase GMP-grade (low dsRNA, 250 U/μL)

10629ES

T7 RNA Polymerase GMP-grade (250 U/μL)

10625ES

Pyrophosphatase, Inorganic GMP-grade (1 U/μL)

10620ES

Murine RNase inhibitor GMP-grade (40 U/μL)

10621ES

10× Transcription Buffer 2 GMP-grade

10670ES

ATP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10652ES

CTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10653ES

UTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10654ES

GTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10655ES

环化

T4 RNA Ligase 2

14652ES

T4 RNA Ligase 1

14651ES

纯化

RNase R (20 U/μL)

14606ES

RNase R GMP-grade (20 U/μL)

14615ES

10×RNase R Reaction Buffer GMP-grade

14616ES

参考文献:

1. Qu L, Yi Z, Shen Y, et al. Circular RNA vaccines against SARS-CoV-2 and emerging variants. Cell. 2022;185(10):1728-1744.e16. doi:10.1016/j.cell.2022.03.044

2. Chen L, Wang C, Sun H, et al. The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis. Brief Bioinform. 2021;22(2):1706-1728. doi:10.1093/bib/bbaa001

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